你好，如果淘宝商家版保证金一千元不见了，可以尝试以下解决方法：
1. 联系淘宝客服：登录淘宝商家版后台，找到客服联系方式，向淘宝客服反映情况，说明保证金的情况，寻求解决方案。
2. 寻求帮助：在淘宝商家论坛或社群中，向其他商家咨询是否有类似的情况，并询问他们是如何解决的，或者是否有推荐的解决途径。
3. 法律咨询：如果上述方法无法解决问题，可以咨询专业的法律机构或律师，了解保护自身权益的法律手段和途径。
4. 投诉举报：如果涉及到诈骗或其他违法行为，可以向相关部门或机构举报，如工商部门、公安机关等。
无论采取何种方式，都建议详细记录相关的证据和沟通过程，以备后续处理。